胡荣贵研究员

文章出处: 作者: 发布时间: 2015-02-13 访问次数: 791

胡荣贵研究员


个人简历:

胡荣贵, 2000年于中国科学院上海生物化学研究所获博士学位。2001年至2006年在加州理工学院生物系从事博士后研究。2006年起任加州理工学院生物系高级研究员(Senior Research Fellow)20097月起担任中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员,建立蛋白质稳态调控与分子识别课题组。2010年入选中科院百人计划,加入分子生物学国家重点实验室。2014年加入中科院系统生物学重点实验室。

研究方向:

胡博士主要致力于研究蛋白质泛素化及降解调控的分子机制及其生理病理意义。胡博士发现了泛素-蛋白酶体系统中最经典的N-end rule途径的第一个蛋白质底物家族,并且阐明一氧化氮信号途径介导蛋白质亚硝基化及后续氧化调控蛋白质泛素化的新机制(Hu et al 2005 Nature Hu et al 2008 PNAS)。课题组成立以来,既致力于机制性的基础研究工作也注重发展原创性的系统生物学方法。

近期工作总结

2014年发表的工作,报道了一种可在蛋白质组学水平定量研究蛋白质降解的系统生物学工具-ProTA方法,作为概念性的验证,ProTA已被用于研究化疗药物Bortezomib的作用机制和肿瘤耐药性产生的可能分子基础(Yu et al 2014 Cell Research);发现铁代谢调控肿瘤抑制因子p53信号的新机制促进肿瘤发生的新机制(Shen et al 2014 Cell Reports);阐明泛素信号调控自噬受体复合物的形成,调控细胞自噬与肿瘤发生发展的新机制(Liu et al 2014 Cancer Cell)。获得支持以后胡博士的研究团队将在建立和发展多种研究蛋白质泛素化、类泛素化及蛋白质降解组学等的系统生物学研究工具的基础上,研究蛋白质泛素降解等稳态调控及其异常的生理病理意义,尤其关注泛素信号与细胞自噬途径交叉调控的分子机制及其异常与肿瘤等人类疾病中发生发展的关系。

学术任职及成果:

目前担任中国生物化学与分子生物学学会全国酶学专业委员会委员、上海市生物物理学会蛋白质与多肽委员会主任、以及中国生物化学与分子生物学学报、中国细胞生物学报等杂志的编委。以第一或通讯作者在NatureCancer CellProc Natl Acad Sci USACell ResCell RepBiomaterialsJ Mol Cell Biol J Biol Chem等刊物发表多篇研究论文, 其研究成果多次被国际学术期刊如Nat Rev Mol Cell BiolJ Cell BiolSci SignalChem Biol等选为亮点或专文评述。已获美国专利授权1项、目前两项进入PCT阶段。先后主持(组长)或参与过国家“973”项目、蛋白质科学重大研究计划、国家自然科学基金项目等课题十多项。近期获得中科院百人计划、浦江人才计划、赛诺菲-SIBS青年科学家奖、国际泛素会议奖等。回国后共培养博士3名和硕士3名,1人中国科学院院长优秀奖,多人获全国性会议论文奖。

主持的课题

2010-2012   中国科学院“百人计划”择优支持,负责人

2011-2013   国家自然科学基金委面上项目基金委面上项目,

蛋白质精胺酰化的生理功能,负责人。

2010-2012   上海市浦江人才

蛋白质精氨酰化修饰生理作用的机理研究, 负责人。

2012-2016   科技部蛋白质科学重大研究计划,

炎症诱导肿瘤的信号转导网络研究,学术骨干

2012-2013   中科院苏州吴中转化医学中心项目

2013-2016   国家自然科学基金委面上项目基金委面上项目,自噬受体蛋白

Optineurin泛素化修饰的分子机制及生理病理意义,负责人。

2013-2017   科技部973项目,蛋白质赖氨酸修饰调控的分子网络,课题组长

2013-2015   中科院重大仪器创制专项基金 共同负责人

2015-2018   国家自然科学基金委面上项目基金委面上项目,

铁代谢调节蛋白质泛素化及降解的分子机制,负责人。

教育背景

1991.09-1995.07 安徽师范大学生物系 学士

1995.09-2000.07 中国科学院上海生物化学研究所博士

工作经历

2000.08-2001.03 中国科学院生物化学研究所 助研

2001.04-2006.12 加州理工学院生物系蛋白质降解调控研究实验室 博士后

2007.04-2009.07 美国加州理工学院生物系高级研究员

2009.07-今中国科学院上海生命科学研究院研究员

研究生培养和教学:

现有在生科院注册研究生11名(不含一年级学生),已有3名博士生和3名硕士生毕业。并有一人获中国科学院院长优秀奖,一人获中国科学院大学优秀毕业生称号,一人获中国科学院大学三好学生标兵称号。

代表性论文及论著

1.Liu Z., Chen P., Gao H., Gu Y., Yang J., Peng H., Xu X., Wang H., Yang M., Liu X., Fan L., Chen S., Zou J., Ruan K., Komatsu M., White E., Ji H., Finley D., Hu R*. Ubiquitylation of Autophagy Receptor Optineurin by HACE1 Activates Selective Autophagy for Tumor Suppression. Cancer cell. 2014. 26(1):106-20. Highlighted by “Science Signaling”.

2.Yu T., Tao Y., Zhang T., Chen Z., Yang M., Chen P., Hou J., Zhang Y., Ruan K., Hu R. Profiling Human Protein Degradome Delineates Cellular Responses to Proteasomal Inhibition and Reveals a Feedback Mechanism in Regulating Proteasome Homeostasis. Cell Res. 2014. 24(10):1214-30. Cover story

3.Shen J., Sheng X., Chang Z., Wu Q., Wang S., Xuan Z., Wu Y., Shang Y., Kong X., Yu L., Li L., Ruan K., Hu H., Huang Y., Wang F., Hu R*. Iron metabolism regulates p53 signaling through direct heme-p53 interaction and modulating localization, stability and function of p53. Cell reports, 2014. 7:180-93. Highlighted by “Faculty of 1000”, “Chemistry & Biology”, “Global Medical Discoveries”.

4.Song G.,Shen J., Hu R. *, Li C., Wang Q., Zou R., Chen Z., Qin Z., Hu J#. Hydrophilic Molybdenum Oxide Nanomaterials with Controlled Morphology and Strong Plasmonic Absorption for Photothermal Ablation of Cancer Cells. ACS Applied Materials & Interfaces, 2014. 6:3915-22. (*Co-corresponding)

5.Shen J., Song G., An M., Li X., Wu N., Ruan K., Hu J., Hu R*.The use of hollow mesoporous silica nanospheres to encapsulate bortezomib and improve efficacy for non-small cell lung cancer therapy. Biomaterials. 2014. 35:316-26.

6.Xu X., Tao Y., Fu X., Yu T., Li Y., Chen K., Ding X., Ruan K., Jing N., Hu R*. ZIP-seq: genome-wide mapping of trinucleotide repeats at single base resolution. JMCB. 2014. 6(1):93-6.

7.Song G.Wang Q., Wang Y., Lv G., Li C., Zou R., Chen Z., Qin Z., Huo K., Hu R., Hu J. Nanocomposites: A Low-Toxic Multifunctional Nanoplatform Based on Cu9S5@mSiO2 Core-Shell Nanocomposites: Combining Photothermal- and Chemotherapies with Infrared Thermal Imaging for Cancer Treatment. Advanced Functional Materials. 2013. 23: 4280-90.

8.Yu Y., Wu A., Zhang Z., Yan G., Zhang F., Zhang L., Shen X., Hu R., Zhang Y., Zhang K., Wang F. Characterization of the GufA subfamily member SLC39A11/Zip11 as a zinc transporter. J Nutr Biochem. 2013 Oct. 24(10):1697-708.

9.Song G., Li C., Hu J., Zou R., Xu K., Han L., Wang Q., Yang J., Chen Z., Qin Z., Ruan K., Hu R*. A simple transformation from silica core–shell–shell to yolk–shell nanostructures: a useful platform for effective cell imaging and drug delivery. J. Mater. Chem. 2012. 22:17011-8.( # Co-corresponding)

10.Xue J., Lv D-d., Jiao S., Zhao W., Li X., Sun H., Yan B., Fan L., Hu R., Fang J. pVHL Mediates K63-Linked Ubiquitination of nCLU. PLoS ONE. 2012. 7(4):e35848.

11.Shen J., Sheng X., Chang Z., Hu R*. The heme-p53 interaction: linking iron metabolism to p53 signaling and tumorigenesis. Molecular & Cellular Oncology. 2014 DOI:10.4161/23723548.2014.965642 (Invited review)

12.Liu Z., Hu R*. Recent progress on the crosstalk between ubiquitin signaling and regulation of selective autophagy. Chinese J. Cell Biol. 2014, 36(10): 1331–1334. (Invited review)

13.ShenJ., Wang F., Hu R. Recent progress on the regulation of iron metabolism by the ubiquitin-proteasome system. Life Science,2013,24(8):785-93. (Invited review)

14.Hu R.G., Wang H., Xia Z., Varshavsky, A. (2008) The N-end rule pathway is a sensor of heme. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 105(1):76-81. Highlighted by“Faculty of 1000”

15.Hu R.G., Brower, C. S., Wang, H., Davydov, I. V., Zhou, J., Kwon, Y. T. and Varshavsky, A. (2006) Arginyl-transferase, its specificity, putative substrates, bidirectional promoter, and splicing-derived isoforms. J. Biol. Chem. 281(43): 32559-73.

16.Graciet, E. Hu R.G., Piatkov, K., Rhee, J. H., Schwarz, E. M. and Varshavsky, A. (2006) Aminoacyl-transferases and the N-end rule pathway of prokaryotic /eukaryotic specificity in a human pathogen. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 3078-3083.

17.Hu R.G., Sheng J., Qi X., Xu Z., Takahashi T.T. and Varshavsky A., (2005) The N-end rule as a nitric oxide (NO) sensor, controlling the levels of multiple regulators. Nature. 437(7061):981-6. (Article)

(Comments see "Yet another job for a gas". Nature Review Mol .Cell Biol. 2005. 6: 822-823; "No link to destruction". J. Cell Biol., 2005. 171(3): 406-407; "Nitric Oxide Signaling: NO Spells End for RGS Proteins" Science STKE, 2005 (306): tw362; "Protein Degradation and NO: The beginning of the N-End". Feature article, Nature AFCS, October 2005.)

18.Kwon YT, Kashina AS, Davydov IV, Hu R.G., An JY, Seo JW, Du F, Varshavsky A. (2002) An essential role of N-terminal arginylation in cardiovascular development. Science. 5;297(5578):96-9.

19.Chen H.Y., Hu R.G., Wang B.Z., Chen W.F., Liu W.Y. Schroder W, Frank P, Ulbrich N., (2002) Structural studies of an eukaryotic cambialistic superoxide dismutase purified from the mature seeds of camphor tree. Arch Biochem Biophys., 404(2):218-26

20.Hu R.G., Zhai Q.W., He W.J., Mei L., Liu W.Y. (2002) Bioactivities of ricin retained and its immunoreactivity to anti-ricin polyclonal antibodies alleviated through pegylation. Int J Biochem Cell Biol.34(4):396-402.

21.Xie L., Wang B.Z., Hu R.G., Ji H.B., Zhang L., Liu W.Y. (2001) Structural and functional studies of cinnamomin, a new type II ribosome-inactivating protein isolated from the seeds of the camphor tree. Eur J Biochem. 268(22):5723-33.

22.Hu R.G., Zhai Q., Liu W., Liu X.. (2001) An insight into the mechanism of cytotoxicity of ricin to hepatoma cell: roles of Bcl-2 family proteins, caspases, Ca(2+)-dependent proteases and protein kinase C. J Cell Biochem.;81(4):583-93.

23.Tang S., Hu R.G., Liu W.Y., Ruan K.C. (2000) Non-specific depurination activity of saporin-S6, a ribosome-inactivating protein, under acidic conditions. Biol Chem. 381(8):769-72.

24.Hu R.G., Tang S., Liu W.Y. (2000). The pH-dependent interaction of cinnamomin with lipid membranes investigated by fluorescence methods. Biol Chem. 381(7):567-73.

25.Xu Y.Z., Li Y.J., Hu H.Y., Hu R.G., Wu H., Liu W.Y. (2000). Adenine nucleotide N-glycosidase activity of the A-chain of cinnamomin characterized by 1H-nuclear magnetic resonance. Biol Chem. 381(5-6):447-51.

26.Hu R.G., LiuW.Y. (1999). Extra-ribosomal functions of ribosomal proteins. Chemistry of Life. Vol. 17(1): 23-25 (invited review).

27.Hu R.G., Liu W.Y. (1998). Mapping the cell's nucleus. Chemistry of Life. Vol.16.(4):13-15 (invited review).

Patents:

1. Modulation of nitric oxide signaling through signaling through specific regulation by arginylation and the N-end rule pathway” Hu R.G. et al. 2009, No. US 7575881. 已授权.

2. Innovation and the application of Zip-Seq techniques and associated algorithm to map trinucleotide repeats in mammalian genomes. 2013, Application No. 201310390859.3. 已进入PCT.

3. Innovation and the application of ProTA (Protein turnover assay) to profile mammalian protein degradomes. 2013, Application No. 2013101284092.8. 已进入国际PCT.